經(jīng)過十三年發(fā)展，深圳先進(jìn)院目前已初步構(gòu)建了以科研為主的集科研、教育、產(chǎn)業(yè)、資本為一體的微型協(xié)同創(chuàng)新生態(tài)系統(tǒng)，由九個(gè)研究平臺(tái)（中國科學(xué)院香港中文大學(xué)深圳先進(jìn)集成技術(shù)研究所、生物醫(yī)學(xué)與健康工程研究所、先進(jìn)計(jì)算與數(shù)字工程研究所、生物醫(yī)藥與技術(shù)研究所、廣州中國科學(xué)院先進(jìn)技術(shù)研究所、腦認(rèn)知與腦疾病研究所、合成生物學(xué)研究所（籌）、先進(jìn)材料科學(xué)與工程研究所（籌）、前瞻性科學(xué)與技術(shù)中心），國科大深圳先進(jìn)技術(shù)學(xué)院，多個(gè)特色產(chǎn)業(yè)育成基地（深圳龍華、平湖及上海嘉定）、多支產(chǎn)業(yè)發(fā)展基金、多個(gè)具有獨(dú)立法人資質(zhì)的新型專業(yè)科研機(jī)構(gòu)（深圳創(chuàng)新設(shè)計(jì)研究院、深圳北斗應(yīng)用技術(shù)研究院、中科創(chuàng)客學(xué)院、濟(jì)寧中科先進(jìn)技術(shù)研究院、天津中科先進(jìn)技術(shù)研究院、珠海中科先進(jìn)技術(shù)研究院、蘇州先進(jìn)技術(shù)研究院、杭州先進(jìn)技術(shù)研究院、武漢中科先進(jìn)技術(shù)研究院、山東中科先進(jìn)技術(shù)研究院）等組成。 

　　2018年，深圳先進(jìn)院獲批牽頭建設(shè)深圳市兩大重大科技基礎(chǔ)設(shè)施：腦解析與腦模擬，合成生物研究；并正在全力籌建深港腦科學(xué)中心，合成生物學(xué)、先進(jìn)電子材料等國際創(chuàng)新研究院；未來將在河套深港科技創(chuàng)新合作區(qū)布局建設(shè)“深港生物醫(yī)藥創(chuàng)新研究院”、“深港高端醫(yī)療設(shè)備創(chuàng)新中心”及“前瞻性國際化綜合性研發(fā)平臺(tái)”等創(chuàng)新平臺(tái)。2018年11月16日，深圳市人民政府與中國科學(xué)院在深簽署《合作共建中國科學(xué)院深圳理工大學(xué)協(xié)議書》，依托深圳先進(jìn)院及中科院在粵科研力量建設(shè)中國科學(xué)院深圳理工大學(xué)（暫定名）。